prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.

2020

• The impact of tunnel mutations on enzymatic catalysis depends on the tunnel-substrate complementarity and the rate-limiting step

  KOKKONEN Piia Pauliina SLÁNSKÁ Michaela DOČKALOVÁ Veronika RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar MARQUEZ SANCHEZ - CARNERERO Esther Maria DAMBORSKÝ Jiří KLÁN Petr PROKOP Zbyněk BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2020, ročník: 18, vydání: 2020, DOI

2019

• Controlled Oil/Water Partitioning of Hydrophobic Substrates Extending the Bioanalytical Applications of Droplet-Based Microfluidics

  BURYŠKA Tomáš VAŠINA Michal GIELEN Fabrice VAŇÁČEK Pavel VAN VLIET Liisa JEZEK Jan PILAT Zdenek ZEMÁNEK Pavel DAMBORSKÝ Jiří HOLLFELDER Florian PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  Analytical Chemistry, rok: 2019, ročník: 91, vydání: 15, DOI

• Development of Fluorescent Assay for Monitoring of Dehalogenase Activity

  NEVOLOVÁ Šárka MAŇÁSKOVÁ Elisabet MAZURENKO Stanislav DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  Biotechnology Journal, rok: 2019, ročník: 14, vydání: 3, DOI

• Engineering enzyme access tunnels

  KOKKONEN Piia Pauliina BEDNÁŘ David PINTO G. PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  BIOTECHNOLOGY ADVANCES, rok: 2019, ročník: 37, vydání: 6, DOI

• Exploring the challenges of computational enzyme design by rebuilding the active site of a dehalogenase

  JINDAL Garima SLÁNSKÁ Kateřina KOLEV Veselin DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk WARSHEL Arieh

  Článek v odborném periodiku

  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, rok: 2019, ročník: 116, vydání: 2, DOI

• Fluorescent pH Indicators for Neutral to Near-Alkaline Conditions Based on 9-Iminopyronin Derivatives

  HORVÁTH Peter ŠEBEJ Peter KOVÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk KLÁN Petr

  Článek v odborném periodiku

  ACS Omega, rok: 2019, ročník: 4, vydání: 3, DOI

• Functional switching based on altered enzyme flexibility via InDel mutagenesis of a reconstructed ancestor

  SCHENKMAYEROVA A. PINTO G. MAREK Martin TOUL Martin HERNYCHOVÁ Lenka LIŠKOVÁ Veronika EMOND S. BEDNÁŘ David PROKOP Zbyněk CHALOUPKOVÁ Radka HOLLFELDER F. BORNSCHEUER U.T.

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty

• Light-Emitting Dehalogenases: Reconstruction of Multifunctional Biocatalysts

  CHALOUPKOVÁ Radka LIŠKOVÁ Veronika TOUL Martin MARKOVÁ Klára ŠEBESTOVÁ Eva HERNYCHOVÁ Lenka MAREK Martin RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar PLUSKAL Daniel WATERMAN Jitka PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2019, ročník: 9, vydání: 6, DOI

• Structure-Function Relationships and Engineering of Haloalkane Dehalogenases

  KOKKONEN Piia Pauliina KOUDELÁKOVÁ Táňa CHALOUPKOVÁ Radka DANIEL Lukáš PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří

  Kapitola v knize

  Aerobic Utilization of Hydrocarbons, Oils, and Lipids, rok: 2019, počet stran: 21 s.

• Surface-enhanced Raman Spectroscopy in Microfluidic Chips for Directed Evolution of Enzymes and Environmental Monitoring

  PILAT Zdenek JEZEK Jan KIZOVSKY Martin KLEMENTOVA Tereza KRATKY Stanislav SOBOTA Jaroslav SAMEK Ota ZEMANEK Pavel BURYŠKA Tomáš DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Článek ve sborníku

  2019 PHOTONICS & ELECTROMAGNETICS RESEARCH SYMPOSIUM - SPRING (PIERS-SPRING), rok: 2019